儀器誤差：儀器誤差主要是由于儀器不準所導致的，例如儀表刻度盤分度不準確或者零點不準，就會導致檢驗結果偏小或者偏大的情況，這種誤差是一個恒值;電子天平使用時間過長后如果沒有進行校準，則必然會出現稱量誤差;玻璃量器沒有經過質量以及刻度的檢驗，從供應商買來后進行進行使用等均會造成儀器誤差的出現。
試劑誤差：試劑誤差主要是由于試劑不純或者無法達到實驗要求所導致的，例如食品理化檢驗過程中使用的試劑存在雜質，或者蒸餾水、試劑中存在會影響檢驗結果的干擾物，或者由于儲存或者操作環境所導致的試劑變化等均會造成試劑誤差。
近些年，我國食品產業迅猛發展，各種類型的食品加工生產企業越來越多，良好的發展前景使一些置國家法律于不顧，添加或濫用食品添加劑等行為屢禁不止，這些為了能夠迎合消費者對食品口感、外觀、保存時間等方面的需求，開始進行摻雜摻假行為，因此，建立健全科學的食品檢測體系就顯得十分重要，而食品檢測服務通過對食品的檢測，將食品中的不良物質以及營養成分進行分析，在一定程度上保障了食品安全生產，提升了國家對食品的檢測能力，進一步提高了人們的生活質量與安全。
食品安全檢測機構相似度高、檢驗項目重復。我國現有食品安全檢測機構約1100家，這些檢測機構隸屬于質檢部門、門、門、食品藥品監督管理部門、工商行政部門等。有些實驗室之間從實驗室設置、儀器種類甚至型號都相同，造成了很多檢測機構的檢驗項目一致，僅檢測的樣品不同。如門的檢測樣品多為蔬菜、水果、谷物等初級農產品;質監部門的檢測樣品除原材料外，多為加工食品;FDA的檢測多為餐飲原料乳、魚、蛋、蔬菜、谷物等，以及部分餐飲產品。但這些檢測項目都具有高度的相似性，都包括細菌和霉菌檢測、化學污染檢測，而且大部分檢測機構都能對細菌學檢驗、農藥殘留、重金屬、獸藥殘留等進行檢測，而不能對等物質進行檢測。
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